Laboratorios Clínicos de Puebla ha venido ofreciendo, desde 1960, un Programa de Especialización en Patología Clínica para Médicos Generales, de dos años de duración que, a partir de 1997, se incrementó a tres años. En esta Residencia Médica -reconocida por la Comisión Interinstitucional para la Formación de Recursos Humanos para la Salud- los egresados de dicho Programa reciben un Diploma de Especialista de la Facultad de Medicina de la Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla, con la que Laboratorios Clínicos de Puebla firmó un convenio de reconocimiento en junio de 1990 y que les otorga el título universitario de Especialistas en Patología Clínica. Los médicos egresados son reconocidos (luego de llenar los requisitos y haberse examinado) por el Consejo Mexicano de la Especialidad. En el año 2008, este programa fue inscrito en el Programa Nacional de Postgrados de Calidad de la Secretaría de Educación Pública como un Programa Consolidado; como resultado de este logro, los alumnos que llenan todos los requisitos de ingreso, perciben becas del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología. De la Residencia de Patología Clínica han egresado, de 1960 al año 2009, un total de 56 profesionales.

También a nivel de postgrado, se han impartido múltiples cursos monográficos sobre tópicos en los que la institución ha adquirido mayor experiencia, como en las áreas de las hemoglobinopatías, gamopatías monoclonales, inmunofluores-cencia, inmunohistoquímica y citometría de flujo. A estos cursos han asistido profesionales de la capital y el interior del país, así como de Colombia, Cuba, Estados Unidos de Norteamérica, Puerto Rico, Uruguay y Venezuela. Finalmente se han recibido como visitantes, por temporadas de duración variable, a profesionales de otros estados, de la Ciudad de México, y del extranjero. Otras tesis que se han apoyado son aquellas que realizan los  residentes de la Especialidad en Patología Clínica, como requisito para obtener su Diploma.

Algunos de los profesionales que trabajan en la institución son, o han sido, catedráticos de pre y postgrado en la Facultad de Medicina de la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla (BUAP), la Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla (UPAEP), la Escuela de Ciencias Químicas de la Universidad de las Américas Puebla (UDLAP) y la Escuela de Ciencias de la Universidad Iberoamericana Golfo-Centro (UIA).

Mensualmente la institución pública un pequeño Boletín, "Clínica y Laboratorio", que recientemente inició su vigésimo octavo año de aparición ininterrumpida, orientado a difundir, entre otros, datos relevantes de la historia de la medicina; interpretación de pruebas de laboratorio; eventos académicos y a promover las nuevas adquisiciones técnicas y de diagnóstico que se desarrollan en la institución. A la fecha el boletín se envía a 1147 médicos de los cuales 541 radican en la ciudad de Puebla y los restantes (606) en otras ciudades del país y del extranjero.

La Clínica Ruiz dispone de la biblio-hemeroteca "Dr. Héctor Labastida Muñoz" que actualmente cuenta con cerca de 3,800 volúmenes y recibe un total de 69 revistas periódicas, en su mayoría extranjeras, sobre distintas áreas de la medicina, pero predominan aquellas relacionadas con la medicina de laboratorio y especialidades afines como la hematología y la inmunología.

Las actividades de enseñanza las coordina la Dirección de Enseñanza e Investigación. Esta se encarga, entre otras funciones, de organizar las labores académicas diarias y programar las sesiones de revisión bibliográfica, los seminarios, las pláticas informales, las sesiones clínico-patológicas mensuales y los cursos básicos internos que se ofrecen a los Residentes de Patología Clínica y a los estudiantes de pre y postgrado que visitan la institución.

En la actualidad se ofrece un Programa de Especialidad en Patología Clínica y diversos Cursos Monográficos. Adicionalmente, se ofrecen apoyo y dirección para la realización de tesis de pregrado y servicios social, así como adiestramientos de tipo tutelar en distintas áreas del laboratorio clínico.